我国毛竹基因组学研究取得重大希望

我国科学家日前完成了包罗毛竹叶片、笋和萌发种子等在内的毛竹全长cDNA文库构建，并正确测定了1万余条基因序列。
这是公共数据库中继水稻和拟南芥以外，第三大的植物全长cDNA数据信息资本，第一次提供了大量竹亚科基因序列信息，填补了禾本科植物比较基因组学研究的一个空缺，为进一步的基因组测序设计提供了有用的基因注释依据。
毛竹全长cDNA文库构建和基因序列正确测定，是“毛竹基因组测序研究”重大科研项目的第一部门。该项目由财政部、科技部支持，国家林业局行业科研专项立项重点支持，中国林业科学研究院林研所、国际竹藤网络中心与中国科学院国家基因研究中心互助肩负。
科学家们在完成毛竹全长cDNA文库构建并正确测定1万余条基因序列的同时，还首次根据毛竹大规模的基因序列统计了毛竹基因的一些基本信息，包罗GC含量、密码子使用偏好性、简单重复序列、小分子RNA和转座子的统计等。另外，科学家们根据判定到的42组禾本科同源基因，举行了系统发育树分解，分解显示毛竹与水稻具有最近的进化关系。这对禾本科植物的进一步研究提供了极其重要的信息，对林业领域基因组学研究是一个重大突破。
同时，作为大规模开展毛竹基因组测序的下午性基础研究工作，科学家们还顺利完成了两套高质量、高覆盖率的毛竹BAC文库构建工作，为全面开展毛竹基因组测序研究的各项预研工作做好了准备。
毛竹是天下上较重要的竹类植物之一，也是我国分布范围较广、栽植面积较大、经济价值较高的竹种，在禾本科植物中占有特殊的职位。而禾本科类植物是人类获取食物和潜在可再生能源的重要来源。为了举行更全面的比较基因组学的研究，科学工作者需要不停积累来自于不同种类的禾本科植物的基因信息和基因组信息。现在，在公共数据库中，禾本科的大多数亚科(跨越100个种类)都有大量相应的基因组信息或表达信息，只有竹亚科(包罗约1000多个种类)仅有少量的序列信息。毛竹全长cDNA文库构建的完成和1万余条基因序列的正确测定填补了这一方面的空缺。