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毛竹基因组序列测序工作全面完成,填补了天下竹类植物基因组学研究空缺,开创了我国林木基因组学研究先河。在北京举行的“毛竹基因组测序研究”项目成果消息公布会公布了这一消息。
“毛竹基因组测序研究”项目由国际竹藤中心、中国林科院林业研究所和中国科学院国家基因研究中心等科研单位的科学家配合组织开展,江泽慧教授主持。项目组从2021年开始相关研究工作,采取第二代高通量测序技术,对毛竹举行全基因组随机测序,得到了相当于毛竹基因组150倍覆盖率的原始序列,组装出高质量的序列草图。“毛竹基因组序列草图”在天下权威生物学杂志——《自然·遗传学》上在线揭晓,这标志“毛竹基因组测序研究”项目圆满完成。
毛竹基因组包罗跨越20亿个碱基对,是水稻的4.5倍,是高粱的3倍,与玉米相当。鉴于毛竹基因组内含有高比例和大片断的重复序列,项目组科学家们对序列的组装方式举行了勇敢改善,经过几十次实验,终于组装出覆盖基因组95%以上地区的高质量序列草图,展现了60%的毛竹基因组为重复序列所覆盖。这是目宿天下上完全使用第二代测序方式测定的、结构较为庞大的高等植物基因组之一,序列组装的难度甚至跨越了用同样方式测定的高等动物基因组。与此同时,科学家们还对毛竹重要组织举行了深度的转录组测序,得到了大量基因表达信息,结合先期已经揭晓的一万多条全长cDNA序列,注释出近3.2万个高度可靠的毛竹基因,约占毛竹基因总数的90%。由此成立的基因表达谱,覆盖了毛竹大部门的自然生长阶段,其中包罗了非常少见的毛竹开花时期的基因表达数据,成为今后基因成果研究的重要基础性数据。
国际竹藤中心主任江泽慧,国家林业局副局长孙扎根,科技部副部长王伟中,农业部副部长、中国农科院院长李家洋出席公布会并讲话。中国林科院、国际竹藤中心首席科学家彭镇华介绍了“毛竹基因组测序研究”项目科研成果。
孙扎根说,我国是竹类植物资本大国,种植和利用历史悠久。现有竹子种类、竹林面积、竹产品产量均位居天下首位。经过不懈积极,竹产业已成为许多地方壮大地区经济和促进农民就业增收的重要途径,竹子已成为增添森林总量和促进经济社会生长的重要资本,竹文化已成为熏陶人们情操和传承中华文明的重要载体。毛竹基因组测序研究取得的成果,为竹资本定向培育和高效利用提供了强有力的基础理论依据和科技支持,为我国林业开展重要物种的基因成果、分子育种及其他相关领域的研究奠基了坚实的基础,为天下竹类及临近门类植物研究、拓展应用方式积累了经验,对推动我国甚至天下林业生长具有重大意义和深远影响。
毛竹属于禾本科竹亚科植物,是具有较高生态和经济价值的竹类植物,在禾本科植物中占有特殊的职位。我国有毛竹林面积386万公顷,占天下森林面积的2%和所有竹类植物面积的72%。毛竹基因组序列测序工作全面完成,第一次说明晰毛竹于5000万年前从禾本科植物中分化出来,继而于1000万年前形成了四倍体,较后演酿成现代二倍体毛竹的进化历史;第一次从基因组的层面,对包罗快速生长和开花调控在内的毛竹特殊生理历程的形成和机理举行了形貌与注释。这些经过分解和提炼发生的数据与基因组序列一起,为毛竹及其他竹类作物的生物学研究奠基了重要的数据基础,将彻底改变以往竹类植物分子生物学研究中,由于缺少参考序列而发生的研究效率低下和分解误差较高的事态,具有伟大的科学价值和现实意义。
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