毛竹基因组测序研究通过国家验收

7月11日，林业公益性行业科研专项重大项目“毛竹基因组测序研究”通过国家林业局验收。项目由国际竹藤中心主任江泽慧主持，中国林科院、国际竹藤中心和中国科学院国家基因研究中心3家单元配合完成。
毛竹是天下上较重要的木本竹之一，具有重要的生态和经济价值，在山区脱贫致富中施展着重要作用，全球每年竹产品国际商业额近20亿美元。毛竹全基因组测序工作的完成，填补了禾本科植物竹亚科基因组的空缺，将对包罗竹类植物在内的一系列重要物种的基因成果、分子育种、物种进化及其他相关领域的研究发生推动作用。这项研究由我国科研人员自主完成。
项目采取第一代测序技术和第二代高通量测序技术相结合的计谋，得到了毛竹2.05Gb基因组草图，覆盖毛竹全基因组的95%，展望出31987个高度可靠性的基因，成果于2021年2月24日揭晓在国际权威杂志《Nature Genetics》上。这是截至研究成果揭晓时，天下上使用第二代测序方式测定的、结构较为庞大的高等植物基因组之一。
项目利用比较基因组学方式，通过对多物种的直系同源基因家族的聚类与进化分解，首次说明晰毛竹于5000万年前从禾本科植物中分化出来，继而于12021年前形成了四倍体，较后演酿成现代二倍体毛竹的进化历史。同时，展现出二穗短柄草比水稻与毛竹的亲缘关系更近。项目组构建了毛竹不同器官、不同发育时期质料的全长cDNA文库，并测序组装得到了10608条全长cDNA序列和约38000条EST序列。成立了包罗毛竹开花时期等多类型质料的基因表达谱，首次从基因组层面临包罗快速生长和开花调控在内的毛竹特殊生理历程的形成和机理举行了分解。
项目成立了天下上第一个竹子基因组分解与注释数据库，提供了比较基因组、卵白-卵白互作、代谢通路和组学信息可视化分解对象，对促进竹类植物研究具有重要价值。
由9位院士专家组成的验收委员会平等赞成通过验收，以为项目成果为毛竹及其他竹类植物的生物学研究奠基了坚实基础，具有重要的科学价值和应用前景。